На базе Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Алтайский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации действуют следующие диссертационные советы:
Диссертационный совет Д 208.002.01
Специальности совета:
14.01.04 - Внутренние болезни (медицинские науки)
14.01.05 - Кардиология (медицинские науки)
14.01.21 - Гематология и переливание крови (медицинские науки)
Диссертационный совет Д 208.002.03
Специальности совета:
14.01.01 - Акушерство и гинекология (медицинские науки)
14.01.17 - Хирургия (медицинские науки)
14.01.23 - Урология (медицинские науки)
Диссертационный совет Д 999.113.03
Специальности совета:
14.01.11 - Нервные болезни (медицинские науки),
14.03.11 - Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия (медицинские науки)