На базе Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Алтайский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации действуют следующие диссертационные советы:
Диссертационный совет 21.2.001.01
Специальности совета:
3.1.18. Внутренние болезни (медицинские науки)
3.1.20. Кардиология (медицинские науки)
3.1.28. Гематология и переливание крови (медицинские науки)
Диссертационный совет 21.2.001.02
Специальности совета:
3.1.4. Акушерство и гинекология (медицинские науки)
3.1.9. Хирургия (медицинские науки)
3.1.13. Урология и андрология (медицинские науки)
Диссертационный совет 99.0.034.03
Специальности совета:
3.1.24. Неврология (медицинские науки)
3.1.33. Восстановительная медицина, спортивная медицина, лечебная физкультура, курортология и физиотерапия (медицинские науки)